ファイルの尻尾に改行を入れるかどうかユーザに問い合わせる法

(setq require-final-newline t)

を、init.elに書き込む。
tなら、常に挿入される。
改行されたかどうかは文末がEnterされたかどうかで決まるので、
デプロイの際場合によっては文末行が読み取られない可能性があるから。